Ответ: Нельзя (вернее очень сложно и велика вероятность осложнений) стерилизовать гуляющих, беременных и кормящих кошек. Так что в вашем случае - через пару недель после окончательного прекращения лактации, когда котятам будет по 2.5-3 месяца.
Что касается ушек - причин их расчесывания очень много, от ушного клеща до аллергии и инородного тела в ухе. Лечение в каждом случае свое. Покажите кошку ветеринару - он сделает анализ содержимого ушка и назначит лечение.